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研究人员开发诊断测试以检测肠道病毒D68

2019-05-09 13:11:21 市场调查83℃

  研究人员开发诊断测试以检测肠道病毒D68

  2015年7月23日

  华盛顿大学圣路易斯医学院的研究人员开发了一种诊断测试,以快速检测肠道病毒D68(EV-D68),这是一种呼吸道病毒,去年引起儿童异常严重的疾病。根据疾病控制和预防中心(CDC)的数据,疫情以前所未有的速度引起感染,全国有超过1,000例确诊病例,14例死亡。

  发表在8月份的“临床微生物学杂志”上的结果表明,该测试在鉴定各种EV-D68菌株方面非常有效,并减少了检测病毒所需的时间。

  早期鉴定肠道病毒株的程序涉及对病毒基因组区域进行测序,这对于大量患者来说过于繁琐。新测试可以在几个小时内完成,而以前的技术需要几天时间才能完成。研究人员还表示,新的测试比市售的肠道病毒诊断测试更具体。

  “呼吸道病毒感染的商业测试通常不区分导致感冒的鼻病毒和肠道病毒,并且在每个群体中都有许多不同的类型,”资深作者Gregory A. Storch,医学博士,露丝说。 L. Siteman儿科教授。

  “有一种工具可以确定哪些呼吸道疾病实际上是EV-D68对公众健康有利,”他补充说。 “这些类型的测试有助于治疗决策,因为知道患者没有流感或其他可能需要特殊治疗的疾病非常重要。在医院预防感染也很重要,因为医生会为患者提供一种特定的病毒,并使他们远离感染其他感染因子的病人。“

  由于测试技术的细节已经公布,其他实验室可以将其用作模板,以便在发生另一次爆发时创建自己的测试。

  鼻病毒和肠道病毒是呼吸道疾病的常见原因。临床医生通常不会对患有任何病毒感染的病人进行测试,特别是当他们的病情轻微时。但是在去年D68病毒的致命爆发之后,由Storch和Todd N. Wylie领导的研究小组,儿科学讲师,开始致力于开发可以针对EV-D68的测试。

  肠道病毒D68有许多变异与遗传密切相关。但是他们的基因组的微小变化使研究人员“通过一次测试检测所有变种的能力复杂化。由于这种变化,早期的EV-D68测试将错过一些EV-D68变体。

  相关故事流感和感冒是完全不同的疾病,研究显示共同发生ADHD的自闭症儿童有更大的适应性行为障碍研究人员发现DNA修饰增强了我们消除恐惧的能力研究人员分离了每个D68亚型共有的微小病毒DNA序列片段但没有其他病毒。 Wylie开发了一种计算机程序,可以同时比较大量的DNA序列。之前没有其他实验室以这种方式使用公共数据库来收集可用的每种D68变体的核苷酸序列,并将它们与可获得序列数据的所有其他病毒的序列进行比较。 Wylie的技术使得有可能创建一个测试,识别肠道病毒D68的每个已知亚型,同时排除所有其他已知病毒。

  对于EV-D68,新测试比其他测试更有效,其中包括10月由CDC开发的,为应对公共卫生危机而迅速部署的测试。为了评估新的测试,研究人员检查了已知的鼻病毒和肠道病毒组。在他们看到的病毒中,新测试没有错过任何已知的EV-D68样本,并且它没有错误地识别已知为其他病毒的样本中的EV-D68。即使使用少量病毒,该测试仍保持其准确性。

  “有一系列D68病毒,我们的检测方法旨在检测它们,”Storch说。 “我们从其他医院收到了许多肠道病毒样本并对所有医院进行了盲目测试。在我们看到的病毒中,测试100%的时间都在进行。它只检测到EV-D68菌株,它确实检测到所有他们;测试没有发现任何其他肠道病毒或鼻病毒。“

  研究人员描述了新测试的一些可能的局限性。有许多病毒序列不可用,在设计测试时无法考虑。此外,研究人员表示,EV-D68未来可能会发生变异,因此该检测方法可能无法检测到它。

  新的测试是由儿科助理教授Kristine M. Wylie博士以及儿科学系的同事和麦克唐纳基因组研究所的早期工作实现的,他们对EV-D68的基因组进行了测序。去年圣路易斯。

   研究的一个未来领域是调查Wylie的技术是否可以作为模板,为基因组测序的其他病毒创造更多的测试。

   

  资料来源:华盛顿大学医学院

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